From defa83d95af2aac38112fbe71d368397ea4be6e1 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Gargamelle <gargamelle@gargantext.org> Date: Sun, 17 Jan 2021 11:44:13 +0100 Subject: [PATCH] [phylo] quality function reparameterized to have high levels for lambda-->1 and low levels for lambda-->0 --- devops/debian/install | 70 +++++-------------------------------------- 1 file changed, 7 insertions(+), 63 deletions(-) diff --git a/devops/debian/install b/devops/debian/install index 0ae92802..bbe3ed3e 100755 --- a/devops/debian/install +++ b/devops/debian/install @@ -21,9 +21,9 @@ sudo apt upgrade sudo apt install tmux htop ######################################################################## -sudo sed -i "s/stretch/buster/g" /etc/apt/sources.list +#sudo sed -i "s/stretch/buster/g" /etc/apt/sources.list #sudo apt update -sudo apt dist-upgrade +#sudo apt dist-upgrade # sudo reboot #recommended ######################################################################## @@ -36,19 +36,19 @@ sudo apt install git ######################################################################## -echo "Which user?" +#echo "Which user?" #read USER USER="gargantua" -sudo adduser --disabled-password --gecos "" $USER +#sudo adduser --disabled-password --gecos "" $USER ######################################################################## #cd /home #sudo mv -if /home/$USER /srv/ #sudo ln -s /srv/$USER -curl -sSL https://get.haskellstack.org/ | sh +#sudo apt install curl +#curl -sSL https://get.haskellstack.org/ | sh -sudo apt install curl sudo su $USER stack update stack upgrade @@ -118,63 +118,7 @@ fi ## POSTGRESQL DATA (as ROOT) ####################################################################### -./devops/debian/install-postgres +#./devops/debian/install-postgres # configure the database with script in devops/postgres # edit gargantext.ini - - - - ..........,,;;;;,,,oKXNNNNNNNNNXXXXXKK0OOxdl::ccc:::::;;;;,,,'.. - .........';;;;;;,,,,'''''''''dXNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWWWNNNWNNNNNNXXXXKKK0Oxddlcc::::::::;;;,,,'.... - .........',,,;;;;,,,'''''''''''''''''''oXNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWWWWWNNNNNNNXXXXKKK0Oxddlcccc::;; - .::cccllc:;''''''''''''''''''''.''''''''oXNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWNNNXXXXKK0O -...';;;;;;;;;,'''''''''''''''''''''''''''''oXNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWWWWNNNNNNX0 -;;,,'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''oXNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWX -'''''''''''''''''''''''''''''''''',;:::cclldkOOOOO00000KKKXXNWWMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMNX -'''''''''''''''''''''''''''';:loodkkOO0KKXXkc:;;;;:::::cccloodxkkO0NMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMNX -''''''''''''''''''','''''',,:okKKNMMMMMMMMMk;,'''''''',''''''',;;cd0MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMNX -''''''''''''''''''''''',:lxxk0KNNWMWWWNXKKKkoooolllcc:;,''''''',,:lOMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWX -''''''''''''''''''',:llx0XWWMMWWWX0kddolcccx0KXXXXKKK0Okxxo:;'''';:OMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWX -'''''''''''''''''':oOXXNMMMMNXOddl:,'''''''oXNMMMMMMMMMMWWX0l'''';:kMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWX -'''''''''''''''':lONWMMMMNXXkl:,,''''''''''dXNMMMMMMMMMMMMWWx,,'';:kMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWX -,'''''''''''',::xXNMMMMWWOoo:''''''''''''''dXNMMMMWNNNNWWWMMk:;'';cOMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWX -,'''''''''''':oo0MMMMMMWXd,,,,''''''''''',,dXNMMMMNXXXXNWWMMOc;'';cOMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWX -'''''''''''''lOOXMMMMMMXkl'''''''''''''''''dXNMMWNKOOOO0KKNMKxoccod0MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWX -,'''''''''',:kWWWMMMWWWk:,'''''''''''''''''dXNMMXOkxxxxxxx0NNNXKKKXNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWX -,''''''''''cxKMMMMMMNKKo'''''''''''''''''''dXNMMXOkxxxxxxx0NWMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWX -'''''''''''oKNMMMMMMKddc'''''''''''''''''''dXWMMNX0OOOkO00XWMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWX -,''''''''''dNWMMMMMM0oo:'''''''''''''''''''oXNMMWWX000OKNNWMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWX -,'''''''',,xWWMMMMMMOcc;'''''''''''''''''''oXNMMMWNNNXXNWWWMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWX -,''''''',;;kMMMMMMMMk;;,'''''''''''''''''''dXWMMMMMMMMWMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWX -,''''''',::kMMMMMMMMk;;,'''''''''''''''''''dXNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWX -,''''''';::kMMMMMMMMk;;,'''''''''''''''''''dXNMMNKOkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkOOOXMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWX -,''''''',;;kMMMMMMMMO::;'''''''''''''''''''dXNMMKxo::::;,,,,,,,,,,,;;;;:cll0MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWX -,''''''',,,kMMMMMMMMOcc;'''''''''''''''''''oXNMMXkocc::;,,,''''''''',,;:loo0MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWX -,'''''''',,xWWMMMMMM0ll:'''''''''''''''''''oXNMMNX0OOOkkxxc'''''',,cxxkkO00XMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWX -,''''''''''oKNMMMMMMKkkc'''''''''''''''''''dXWMMMMMMMMMWWWx,,'''',;kMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWX -,''''''''''cdKMMMMMMNXXo'''''''''''''''''''dXWMMMMMMMMMMMMk,,'''',:kMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWX -,'''''''''',;xWWWMMMMWWk:;'''''''''''''''''dXNMMMMMMMMMMMMk,,'''',:kMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMNX -,''''''''''''lkkKMMMMMMX0o'''''''''''''''''dXNMMMMMMMMMMMMx,,'''',:kMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWX -,'''''''''''':llOMMMMMMWWx,,,''''''''''''''dXNWWMMMMMMMMMMk,,'''',:kMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWX -,'''''''''''',::xXNMMMMMW0oo:''''''''''''''dXNMMMMMMMMMMMMk,,'''',;kMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWX -;,,''''''''''''':lONWMMMMWNNOl:''''''''''''oXNMMMMMMMMMMMMx,,'''',:kMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMNX -.';,,,,''''''''''':dONNWMMMMWXOddl:,'''''''dXNMMMMMMMMMMMMk,,'''',:kMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMNX - .',,,;,''''',,''',:ookKNMMMMWWWXOxddlc:;;xXNWWWWWWWNXXKKd,,'''',:kMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMNX - .'',:;''''''''''''''cxKMMMMMMMMMWNN0xollxKXWWWWNXXK0Okkl,''''';:kWWMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMNX - ....';;,''''''''''';cokk0XWMMMMWWWXK0OOkxxxxdddddoolcc;'''',,:lOMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWNK0 - ...,;,,,,'''',,'',,,:odkkO0KXXNNWWWk:;'''',,,;;:ccclodxkkO0XMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWNNNX0kko:;, - .';;;;,'''''''''''',,;:clloodddxxxxxxxkkkOO000KXNWWMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWNNXX0kocc:;'.. - ....';,''''''''''''''''''''''dXNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWNNXX0koc:;;'. - ..,;;;,''''''''''''''''''dXNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWWWNXKOOd::;;'. - .cc:,''''''''''''''''''dXWMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMNXXK0dcc. - ...,;;,,,''''''''''''''dXWMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWNNNNKOdcc::,... - ..'',;,''''''''''''oXNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWNNNXKOOd::::,.. - ..';;,'''''''''oKNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWWNXXKOd::::,... - ..';;,,,''''oXNMMMMMMMMMMMMWWNXKOOdc:;;,.. TODO, too big, what diet for this ascii art ? - .::;;,''''oXNWWMMMMMMMMMMWNK0d::. - ..',,,,,''oKNMMMMWWWNX0OOdc:;,.. - ....';;o0KXXKOdcc:;,... - .ccdOO00xl. - - -- 2.21.0